Los habitantes de Isla Pájaro e Isla Cerdito mantienen una inocente disputa tras los eventos de la primera película. Cada uno está en paz en su territorio, las “peleas” y bromas entre ambos bandos parecen ser solo una manera de pasar el rato. Hasta que inmensas bolas de hielo llegan a ambos pueblos con el claro fin de destruirlos. Si la amenaza no viene de ningún lugar conocido sólo puede haber una explicación: existe una tercera isla que nadie conocía. Así es que los anteriormente enemigos deben unir fuerzas para conformar un equipo que descubra y detenga al nuevo villano que quiere congelarlos.
